Не до конца понял суть проблемы.
Вероятно она кроется в глючности самого Dreaweavera. Сидишь конечно же не на лицензии, да?
Попробуй найти Namo Web Editor - он в тысячи раз удобней дримвавеа.
Раз уж без редактора ничего сделать не можешь :)

Не столь Dreamweaver и глючен, и даже нелицензионный. Много лет пользуюсь и глюков особых не замечал.
Насколько я понял, не отражается в DW все что между тегами body и /body? Такое может случиться, если, к примеру, у тебя очень грубая ошибка в коде. Ну, к примеру, тег какой-то таблицы не закрыт или еще что-то в этом роде. IE - это "съедает", и показывает все как надо, а вот программа верстки такое может не пропустить. Попробуй сделать так: скопируй код прямо из IE и пропусти его через валидатор.