....ведь Теория Эйнштейна работает только в инерциальных системах_______________
Теория Эйнштейна предполагает ускорение и замедление времени
и в вашем мысленном эксперименте это тоже проследивается.
А Инерциальной называется система отсчёта, по отношению к которой пространство является однородным и изотропным, и время тоже является однородным.
Будучи по условию однородным как же время может сокращаться (т.е. быть неоднородным) в вашем мысленном примере???

Мой мощный и упругий стержень салона корабля длиной в 50 метров опроверг мыслю Эйнштейна

Ну, что поздравляю! Отличная идея. Теперь вперёд, статью в журнал "Science", а там и мировое признание непременно будет. Только вот, маловато доказательств, там формулы какие-нибудь, или ещё чего. Без доказательной базы в журнал могут не принять статью.

Расстояние между А и Б не меняем --- триллион километров.
Ошибка. Расстояние уменьшается, вместе со временем.

Нижнего предела этого промежутка времени нет. Так что оно, в целях данного исследования, будет неотличимо от нуля.
Опять ошибка. Остановки времени можно достичь только достигнув скорости света, что не возможно в принципе.

нейтрино могут изменяться в течении полёта от Солнца к Земле. И при этом иметь световую скорость и нулевую массу.
Вы, вероятно, имели в виду фотоны, а не нейтрино?

Мартила, вам всё объяснили в Физике на Гуляй-Поле. Что вам еще непонятно?

Поскольку любое движение относительно. То пока оно тебя не касается, тебе абсолютно по одному месту до него. Какой бы скоростью оно не обладало.