Проблем столько много, что сложно даже решить с какой начать, то ли с давнего спора о том что понимать под "транспортной безопасностью" и о корректности понятийного аппарата закона ФЗ-16, то ли с несогласованности действий ведомств, то ли с причин взрывов..
А решение проблемы с точки зрения правительственных структур одно - выделить на это мешок денег и срок обозначить).

Давайте просто перечислим ключевые проблемы:
1) Проблема закрытости транспортного рынка и вследствие этого коррупция и рыночная безопасность
2) Проблема неразвитости транспортной инфраструктуры страны - "Дураки и дороги". Безопасность дорог и трасс.
3) Проблема безопасности - это в первую очередь проблема устойчивости системы, если смотреть на транспортную отрасль, как на систему. Такая точка зрения вообще забыта. Сейчас оценим уязвимость каждого объекта и всё.... приплыли
4) ...